Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TULP1O00294 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TULP1O00294 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TULP1O00294 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TULP1O00294 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TULP1O00294 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TULP1O00294 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TULP1O00294 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TULP1O00294 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TULP1O00294 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TULP1O00294 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TULP1O00294 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TULP1O00294 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TULP1O00294 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TULP1O00294 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TULP1O00294 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TULP1O00294 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TULP1O00294 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TULP1O00294 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TULP1O00294 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TULP1O00294 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TULP1O00294 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TULP1O00294 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TULP1O00294 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TULP1O00294 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TULP1O00294 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TULP1O00294 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TULP1O00294 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TULP1O00294 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TULP1O00294 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TULP1O00294 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TULP1O00294 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TULP1O00294 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TULP1O00294 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TULP1O00294 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP1O00294 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP1O00294 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP1O00294 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP1O00294 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP1O00294 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP1O00294 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP1O00294 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP1O00294 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP1O00294 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP1O00294 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP1O00294 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP1O00294 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP1O00294 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP1O00294 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP1O00294 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP1O00294 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TULP1O00294 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP1O00294 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP1O00294 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP1O00294 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP1O00294 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP1O00294 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP1O00294 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP1O00294 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TULP1O00294 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TULP1O00294 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TULP1O00294 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TULP1O00294 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TULP1O00294 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TULP1O00294 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TULP1O00294 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP1O00294 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP1O00294 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP1O00294 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP1O00294 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP1O00294 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP1O00294 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP1O00294 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP1O00294 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP1O00294 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP1O00294 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP1O00294 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP1O00294 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP1O00294 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP1O00294 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP1O00294 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP1O00294 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP1O00294 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP1O00294 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP1O00294 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP1O00294 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP1O00294 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP1O00294 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP1O00294 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP1O00294 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP1O00294 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP1O00294 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP1O00294 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP1O00294 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP1O00294 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP1O00294 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP1O00294 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP1O00294 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP1O00294 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP1O00294 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms