Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAPO00193 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAPO00193 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAPO00193 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAPO00193 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAPO00193 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAPO00193 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAPO00193 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAPO00193 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAPO00193 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAPO00193 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAPO00193 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAPO00193 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAPO00193 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAPO00193 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAPO00193 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAPO00193 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAPO00193 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAPO00193 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAPO00193 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAPO00193 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAPO00193 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAPO00193 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAPO00193 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAPO00193 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAPO00193 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAPO00193 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAPO00193 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAPO00193 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAPO00193 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAPO00193 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAPO00193 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAPO00193 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAPO00193 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAPO00193 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAPO00193 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAPO00193 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAPO00193 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAPO00193 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAPO00193 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAPO00193 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAPO00193 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAPO00193 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAPO00193 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMAPO00193 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAPO00193 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAPO00193 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAPO00193 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMAPO00193 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAPO00193 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAPO00193 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAPO00193 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAPO00193 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAPO00193 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAPO00193 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAPO00193 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAPO00193 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAPO00193 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAPO00193 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAPO00193 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAPO00193 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAPO00193 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAPO00193 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAPO00193 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAPO00193 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAPO00193 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAPO00193 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAPO00193 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAPO00193 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAPO00193 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAPO00193 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAPO00193 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAPO00193 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAPO00193 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAPO00193 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAPO00193 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAPO00193 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAPO00193 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAPO00193 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAPO00193 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAPO00193 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAPO00193 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAPO00193 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAPO00193 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms