Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPSO00116 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPSO00116 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPSO00116 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPSO00116 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPSO00116 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPSO00116 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPSO00116 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGPSO00116 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGPSO00116 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGPSO00116 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGPSO00116 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGPSO00116 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPSO00116 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPSO00116 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPSO00116 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPSO00116 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPSO00116 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPSO00116 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPSO00116 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPSO00116 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPSO00116 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPSO00116 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGPSO00116 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPSO00116 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPSO00116 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPSO00116 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPSO00116 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPSO00116 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPSO00116 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPSO00116 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPSO00116 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPSO00116 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPSO00116 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPSO00116 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPSO00116 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGPSO00116 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPSO00116 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPSO00116 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPSO00116 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPSO00116 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPSO00116 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPSO00116 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPSO00116 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPSO00116 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPSO00116 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPSO00116 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPSO00116 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPSO00116 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGPSO00116 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
AGPSO00116 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPSO00116 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPSO00116 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPSO00116 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPSO00116 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPSO00116 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGPSO00116 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPSO00116 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPSO00116 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPSO00116 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGPSO00116 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPSO00116 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPSO00116 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPSO00116 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPSO00116 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPSO00116 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPSO00116 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPSO00116 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPSO00116 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPSO00116 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPSO00116 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPSO00116 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPSO00116 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGPSO00116 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPSO00116 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPSO00116 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPSO00116 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPSO00116 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPSO00116 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPSO00116 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPSO00116 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPSO00116 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPSO00116 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPSO00116 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPSO00116 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPSO00116 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPSO00116 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPSO00116 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPSO00116 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPSO00116 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPSO00116 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPSO00116 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPSO00116 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPSO00116 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPSO00116 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPSO00116 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPSO00116 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPSO00116 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPSO00116 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPSO00116 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms