Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVH48-1M5A8F1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ERVH48-1M5A8F1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms