Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KT08 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KT08 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KT08 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KT08 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KT08 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KT08 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KT08 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KT08 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KT08 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KT08 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KT08 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KT08 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KT08 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KT08 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
J3KT08 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3KT08 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3KT08 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3KT08 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3KT08 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
J3KT08 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KT08 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KT08 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KT08 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KT08 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KT08 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KT08 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KT08 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KT08 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KT08 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
J3KT08 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KT08 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KT08 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KT08 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KT08 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KT08 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KT08 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KT08 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KT08 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KT08 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KT08 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KT08 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KT08 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
J3KT08 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
J3KT08 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KT08 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KT08 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KT08 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KT08 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KT08 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KT08 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KT08 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KT08 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KT08 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KT08 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KT08 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KT08 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KT08 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KT08 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KT08 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
J3KT08 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
J3KT08 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
J3KT08 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
J3KT08 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
J3KT08 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
J3KT08 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
J3KT08 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
J3KT08 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
J3KT08 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms