Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
CROCC2H7BZ55 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CROCC2H7BZ55 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms