Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BRM9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BRM9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BRM9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BRM9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BRM9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BRM9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BRM9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BRM9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BRM9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BRM9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BRM9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BRM9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3BRM9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BRM9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BRM9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BRM9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BRM9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BRM9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BRM9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BRM9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3BRM9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BRM9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BRM9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BRM9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BRM9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BRM9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BRM9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BRM9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BRM9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BRM9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BRM9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3BRM9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BRM9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BRM9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BRM9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BRM9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BRM9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BRM9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BRM9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BRM9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BRM9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BRM9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BRM9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BRM9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BRM9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3BRM9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3BRM9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BRM9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BRM9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BRM9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BRM9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BRM9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BRM9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BRM9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BRM9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BRM9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BRM9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BRM9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BRM9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BRM9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3BRM9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BRM9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BRM9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BRM9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BRM9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BRM9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BRM9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BRM9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BRM9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BRM9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H3BRM9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BRM9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BRM9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BRM9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BRM9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BRM9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BRM9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BRM9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BRM9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BRM9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BRM9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BRM9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3BRM9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms