Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LH3BP13 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms