Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB6E9PJ23 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms