Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4DGG1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4DGG1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4DGG1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4DGG1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4DGG1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4DGG1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
B4DGG1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4DGG1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4DGG1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4DGG1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4DGG1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4DGG1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
B4DGG1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4DGG1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4DGG1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B4DGG1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
B4DGG1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B4DGG1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DGG1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
B4DGG1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
B4DGG1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
B4DGG1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
B4DGG1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22■■□□□ 1.11
B4DGG1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DGG1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DGG1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
B4DGG1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DGG1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DGG1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DGG1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DGG1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DGG1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DGG1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DGG1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DGG1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DGG1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DGG1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DGG1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DGG1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DGG1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DGG1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DGG1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DGG1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DGG1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DGG1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DGG1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DGG1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DGG1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DGG1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DGG1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DGG1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DGG1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DGG1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DGG1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DGG1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DGG1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DGG1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DGG1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DGG1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DGG1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DGG1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DGG1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DGG1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DGG1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DGG1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DGG1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DGG1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DGG1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DGG1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DGG1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DGG1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DGG1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DGG1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DGG1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DGG1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DGG1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DGG1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DGG1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DGG1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DGG1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DGG1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DGG1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms