Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
B4DEV8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
B4DEV8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
B4DEV8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
B4DEV8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
B4DEV8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
B4DEV8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
B4DEV8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
B4DEV8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
B4DEV8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
B4DEV8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
B4DEV8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
B4DEV8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
B4DEV8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DEV8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DEV8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DEV8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DEV8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DEV8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DEV8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DEV8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DEV8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DEV8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DEV8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DEV8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DEV8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DEV8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DEV8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DEV8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DEV8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DEV8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DEV8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DEV8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DEV8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
B4DEV8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
B4DEV8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
B4DEV8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DEV8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DEV8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DEV8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DEV8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DEV8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DEV8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DEV8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DEV8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DEV8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DEV8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B4DEV8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DEV8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DEV8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DEV8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DEV8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DEV8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DEV8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DEV8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DEV8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DEV8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DEV8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DEV8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DEV8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms