Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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