Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3P2A6NIE6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRN3P2A6NIE6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms