Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMX3A6NHT5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMX3A6NHT5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMX3A6NHT5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMX3A6NHT5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMX3A6NHT5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMX3A6NHT5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMX3A6NHT5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMX3A6NHT5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMX3A6NHT5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMX3A6NHT5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMX3A6NHT5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms