Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGPEP1LA6NFU8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGPEP1LA6NFU8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms