Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms