Protein–RNA interactions for Protein: A6NCK2

TRIM43B, Tripartite motif-containing protein 43B, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43BA6NCK2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM43BA6NCK2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM43BA6NCK2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM43BA6NCK2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM43BA6NCK2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM43BA6NCK2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms