Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQJ5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQJ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PQJ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PQJ5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQJ5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms