Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0U1RRA0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms