Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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