Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY10

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY10 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0J9YY10 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0J9YY10 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms