Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087WWV3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087WWV3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087WWV3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087WWV3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087WWV3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087WWV3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087WWV3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087WWV3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087WWV3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087WWV3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
A0A087WWV3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
A0A087WWV3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A087WWV3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms