Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 338 ms