Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms