Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms