Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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ZNF439Q8NDP4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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ZNF439Q8NDP4 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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ZNF439Q8NDP4 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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ZNF439Q8NDP4 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ZNF439Q8NDP4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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ZNF439Q8NDP4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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ZNF439Q8NDP4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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ZNF439Q8NDP4 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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ZNF439Q8NDP4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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ZNF439Q8NDP4 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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ZNF439Q8NDP4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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