Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms