Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms