Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms