Protein–RNA interactions for Protein: Q15596

NCOA2, Nuclear receptor coactivator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA2Q15596 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA2Q15596 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA2Q15596 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms