Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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