Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FHL3Q13643 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms