Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
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