Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms