Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms