Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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