Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC01547P58512 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms