Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA2P51531 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms