Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AFMP43652 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AFMP43652 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AFMP43652 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AFMP43652 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
AFMP43652 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AFMP43652 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AFMP43652 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AFMP43652 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AFMP43652 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AFMP43652 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AFMP43652 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AFMP43652 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AFMP43652 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AFMP43652 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AFMP43652 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AFMP43652 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms