Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBP1P32455 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP1P32455 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP1P32455 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms