Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 MAP1LC3BP1-202ENST00000438342 516 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms