Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCR1P25024 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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