Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYN1P17600 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYN1P17600 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYN1P17600 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms