Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TPM2P07951 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPM2P07951 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPM2P07951 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms