Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOEP02649 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOEP02649 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms