Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERPINC1P01008 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms