Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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