Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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