Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
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BIVM-ERCC5R4GMW8 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
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BIVM-ERCC5R4GMW8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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