Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FER1L5-206ENST00000624922 6367 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHA6-202ENST00000414478 5091 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D27-201ENST00000261651 4838 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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